Dans un lycée de Tokyo, tout a l'air de bien se passer jusqu'au jour où un étrange message apparaît sur tous les écrans. Le lendemain, la plupart des habitants sont morts, et les survivants vont devoir tenter de comprendre ce qui s'est passé.

Les filles survivantes essaient tant bien que mal de survivre, certaines en groupes, d'autres en solitaires, et tout le monde essaie de tirer son épingle du jeu pour échapper à la mort lors de la prochaine échéance.

Saneatsu explique à Saya qu'il a vu Sudô, et pendant que les survivants tentent de sympathiser, ils essaient de mettre en place une stratégie pour démasquer le traître.

Kazuhiko et Omi sont toujours poursuivis par leur prof, mais un événement inattendu se produit, et ils font la rencontre d'un garçon bien curieux qui dit posséder un droit particulier.

Iruga continue à révéler à Saneatsu et ses amis des informations sur son passé et les origines de certaines personnes en échange d'une demande difficile à satisfaire.

Eren a disparu, Tôjûrô présente Rika à l'équipe de Saneatsu, Saya trouve un privilège, et le professeur Shinozaki pense qu'il vaut mieux tenter de rejoindre lui aussi le groupe de Saneatsu.

À la suite des révélations sur le passé de Saneatsu, celui-ci déclare qu'il ne peut plus rester avec les autres. Pourtant, ses nouveaux camarades lui donnent leur confiance pour affronter la suite, qui s'avère difficile à appréhender.

Maintenant qu'ils peuvent enfin discuter en direct avec Midô, Saneatsu et ses camarades vont l'interroger pour en apprendre le plus possible à propos de la majorité manquante. Cependant, Midô, même s'il répond aux questions, semble avoir un plan bien à lui derrière la tête.

L'heure de l'assaut approche, et les équipes qui vont faire diversion se tiennent prêtes à jouer leur rôle pour soutenir celles qui vont attaquer les centrales.

L'équipe Saneatsu est maintenant arrivée chez l'empereur, et il va leur falloir faire attention à chaque mot et chaque geste pour arriver à prendre le dessus sur leur ennemi.

Après un résumé de la situation expliqué par Gobô et Nishime, les survivants continuent à tenter de préparer leur avenir dans un monde où énormément de gens ont disparu et où le danger est omniprésent.