L'équipe trouve trois jeunes femmes qui ont apparemment été brutalisées de la même façon. L'unique témoin est une victime qui a réussi à s'échapper et qui peut seulement communiquer grâce au clignement de ses yeux.

Lorsqu'une femme est violée à Central Park, l'enquête de Stella visant à arrêter le criminel, est gênée par la victime qui ne se souvient absolument pas de ce qu'il s'est passé. Malgré la présence de nombreuses preuves sur les lieux du délit, les détectives ne parviennent pas à connecter celles-ci à un suspect, au grand dam de Stella qui met un point d'honneur à arrêter le violeur.

Un squelette est retrouvé dans un bus touristique. Mac et Stella enquêtent sur cette macabre découverte et apprennent que ce squelette est celui d'un jeune homme âgé de dix-sept ans.

Mac et Aiden enquêtent sur le meurtre d'un artiste à l'avenir prometteur spécialisé dans le hip-hop qui a été poignardé peu de temps après avoir gagné un concours réunissant les meilleurs D.J. et signé un contrat avec un nouveau label. Par ailleurs, Stella et Danny tentent d'en savoir plus sur la mort d'une créatrice de mode dont le corps a été retrouvé dans sa piscine.

Stella et Aiden enquêtent sur la mort d'une adolescente dont le corps a été retrouvé dans un ruisseau. Mac et Danny s'intéressent à un défunt, retrouvé dans un tunnel.

Octavia Figueroa et Terrell Davenport sont les seuls survivants d'une terrible tuerie et d'un cambriolage qui a eu lieu dans un fast-food. Danny et Aiden doivent redoubler d'efforts car ils n'ont, pour l'heure, aucun suspect. Mais leur enquête avance lorsqu'ils apprennent certains détails de la vie de l'un des survivants. Par ailleurs, Stella et Mac enquêtent sur la mort d'un mort qui avait récemment été amputé d'une jambe.

Un homme, très grièvement brûlé, surgit dans une rue de Chinatown. Lorsque les détectives arrivent sur les lieux pour constater le décès, une autre victime gît dans la salle des coffres d'une banque qu'elle était visiblement en train de cambrioler avec ses complices. Un agent de sécurité a également trouvé la mort durant le braquage. L'un des malfaiteurs semble s'être enfui par le bâtiment adjacent...

Danny et Mac enquêtent sur une sombre affaire. Une mallette appartenant à Luke Sutton, un agent de change, est retrouvée abandonnée à la bourse de New York contenant une lettre signée de sa main et marquée de son sang. Le disparu est bientôt retrouvé, carbonisé au volant de sa voiture. Par ailleurs, Stella et Flack tentent à élucider la mort d'une jeune femme enceinte retrouvée morte dans un jardin derrière une église.

Un tireur isolé abat un officier de la police montée en plein coeur de Central Park. Pour remonter jusqu'à lui, il manque un élément d'importance : la balle qui l'a traversé. Elle s'est logée dans le cou du cheval du policier. Les inspecteurs aimeraient la récupérer car elle représente un indice pour leur enquête mais son extraction causeraient la mort de l'animal. Mac souhaite éviter d'en arriver à cette extrémité et cherche à trouver des indices par d'autres moyens.

Jason, un jeune qui joue au basket dans la rue découvre le cadavre de Rachel Camden. Agenouillée près d'elle, une autre femme ensanglantée - Ophelia Dichiara - lui masse le coeur, les mains plongées dans sa poitrine ouverte. Mac et Stella comprennent qu'Ophelia est somnambule. Elle a refait à Rachel les gestes qu'elle a vu faire sur son petit garçon des années auparavant. Pendant ce temps-là, Aiden Burn et Danny Messer ont affaire à un gang de pickpockets dont l'un des membres - Lenny Cook - a été battu à mort.

Stella et Mac enquêtent sur la mort d'un homme retrouvé électrocuté sur les rails du métro. Par ailleurs, Danny s'intéresse au meurtre du propriétaire d'une galerie et Aiden et Flack à celle d'un ouvrier.

Un coursier est retrouvé poignardé dans les rues de New York. Celui-ci était en service lors de sa mort. Les enquêteurs vont découvrir qu'il n'était qu'un innocent, tué par un piéton par vengeance des cyclistes. Lors d'un défilé canin, la jalousie d'une maîtresse va entraîner la mort d'une autre.

Stella et Mack enquêtent sur la mort de Paul Montenassi, un jeune homme assassiné à coups de batte de base-ball et dont le corps a été retrouvé dans la neige. Celui-ci portait un tatouage affirmant qu'il appartenait à un gang. Danny et Aiden cherchent à comprendre les raisons de la mort suspecte de Marta Santo dans un accident de voiture. Ils découvrent que la victime était prostituée qui travaillait dans un salon de massage particulier.

Le corps d'un jeune trapéziste tout contorsionné est retrouvé dans une petite caisse en bois sur une plage. Mac et Stella se rendent dans un cirque avoisinant afin d'élucider cette affaire. Danny et Flack retrouvent le corps d'une femme dans une buanderie.

Toute l'équipe enquête sur la mort de Hannah Bloom, survenue lors de son mariage. Mais le père de la victime refuse que sa fille subisse une autopsie, le corps de la défunte ayant déjà été béni par un rabbin. Danny et Mac focalisent leur attention sur une femme présente lors de la cérémonie, sans pouvoir pour autant la lier à l'empoisonnement de la jeune femme au formaldéhyde. Stella, Flack et Aiden se rendent dans un monastère, réputé hanté, où une main vient d'être retrouvée...

Stella et Mac découvrent la moitié du corps écrasé d'un homme sous un container puis, peu après, l'autre moitié, sous un autre container dans les docks de New York. La victime a été assassinée par son associé. Par ailleurs, Aiden et Danny enquêtent sur la mort d'une femme retrouvée morte près d'une route.

Trois jeunes membres d'un gang assassinent un vendeur de vin dans le Bronx. Avant de mourir, la victime déclare à la police avoir clairement identifié ses agresseurs comme appartenant à un gang. Mac et Stella, assistés par le détective Flack, enquêtent sur ce meurtre. Par ailleurs, Danny et Aiden tentent d'élucider la mort d'un important producteur de cinéma

La veille de la parution officielle du rapport de la commission Dove sur la corruption au sein de la police, son directeur Dan Stanwyk est abattu alors qu'il assiste à une fête au dernier étage d'un gratte-ciel. Chargés de l'enquête, Stella et Mac doivent retrouver l'assassin. Par ailleurs, Danny et Aiden cherchent à en savoir plus sur le meurtre d'un chauffeur de taxi clandestin.

Le corps d'une jeune femme qui a été égorgée est retrouvé, enveloppé dans un drap, dans une laverie automatique. Cette pièce de tissu mène Mac et Stella dans un hôtel renommé de New York où séjournent des diplomates du monde entier durant une session spéciale des Nations-Unies. Par ailleurs, Danny et Aiden enquêtent sur la mort d'un homme sans-abri, déguisé en statue pour gagner de l'argent.

Un étudiant est frappé puis abattu et son appartement est retrouvé saccagé. En se rendant sur les lieux du drame, les détectives trouvent de l'héroïne. Ils découvrent, par ailleurs, que la colocataire de la victime a disparu. Les méthodes agressives de Stella employées pour interroger un témoin choquent son entourage.

Mac et Danny se rendent dans l'appartement de Jay Knight, qui a été assassiné par balle. Alors qu'ils inspectent les lieux, un homme prend la fuite. Danny le poursuit jusque dans le métro. Croyant tirer sur le suspect, il abat en réalité un policier en civil, l'officier Minhas. L'inspection des services met Danny en cause...

Toute l'équipe enquête sur le meurtre d'un supporter de l'équipe de Boston retrouvé mort dans son véhicule. Danny mène ses recherches dans le milieu du base-ball. Par ailleurs, un camion heurte une jeune femme qui courait, pieds nus et en déshabillé, sur la route au petit matin. Les enquêteurs cherchent à savoir ce qu'elle fait là et d'où elle venait.

Alors que Mac prend son petit-déjeuner dans son café habituel, un des clients ouvre le feu. Un homme et tué et la serveuse, gravement blessée. Unique témoin du meurtre, Mac doit faire un choix : se lancer à la poursuite du témoin ou secourir la jeune femme. Cette affaire est, en fait, liée à de faux-monnayeurs que Stella et Mac tentent d'arrêter.