Une mystérieuse entité traverse l'espace pour atterrir sur Terre et prendre possession du corps d'un prêcheur africain avant d'exploser, et de recommencer dans un temple satanique russe puis avec un scientologue. Au Texas, Jesse Custer, un pasteur qui essaie de tourner la page de son passé criminel, commence à perdre la foi et pense à quitter sa paroisse. Tulip O'Hare, une femme qui connait son passé, revient vers lui avec une proposition qu'il refuse. Cassidy, un vampire irlandais, atterrit près de l'église de Jesse après une chute d'un jet où il était attaqué. Jesse se charge de donner une leçon au père d'un garçon de sa paroisse qui pense que l'homme est violent envers sa mère ; au cours de la bagarre, il sympathise avec Cassidy. Jesse retourne à son église, espérant un signe divin, quand l'entité cosmique entre dans son corps. Trois jours plus tard, il reprend conscience et dans son sermon, se résout à rester pour sa paroisse.

Jesse essaie de se montrer digne de sa charge. Deux hommes apparaissent et pénètrent de nuit dans l'église, mais Cassidy croit qu'ils sont là pour lui et les massacre.

Jesse a pris conscience de son nouveau pouvoir de persuasion et le révèle à Cassidy. Le vampire est surpris de revoir les deux hommes qu'il avait tués auparavant mais ils lui expliquent qu'ils sont des anges venus enfermer l'entité qui possède Jesse. Tulip est parvenu à obtenir l'information qu'elle cherchait : l'adresse de l'homme qui l'a trahi lors de son dernier coup avec Jesse.

Une prostituée meurt au cours d'un des jeux des clients de la maison close et seule Tulip semble être touchée. Cassidy arnaque les anges, trop peu familiers avec les sentiments humains et préoccupés par leur situation. Jessa a une idée pour ramener les fidèles vers son église et il a une proposition à faire à Quincannon.

Depuis son dernier prêche avec Quincannon, le pasteur Custer est devenu la nouvelle coqueluche de la ville et tous les habitants veulent lui demander conseil. Tulip a découvert que Cassidy est un vampire.

Jesse force les anges à lui expliquer la vérité : l'entité qui loge dans son corps est Genesis, un hybride ange-démon aux pouvoirs immenses. Malgré les êtres qui lui en veulent, Jesse veut continuer sa mission. Tulip s'en prend à Emily par jalousie. Eugene réalise qu'il ne veut pas du pardon que lui offre le pasteur.

Jesse ne semble pas si perturbé par la disparition d'Eugene, au contraire de Cassidy qui a tout vu. Il va également découvrir la limite des pouvoirs de Genesis quand Odin Quincannon montre qu'il n'obéit plus à l'ordre. La confusion entre foi et culpabilité chez Jesse remonte à son enfance, son amitié avec Tulip et la mort de son père.

Odin Quincannon a recruté tous les hommes qu'il pouvait pour faire sortir Jesse de son église, alors qu'il est occupé à chercher un moyen de libérer Eugene. Tulip décide d'acheter un chien.

Jesse parvient à s'évader. Tulip part pour Albuquerque, laissant Emily surveiller Cassidy encore blessé et assoiffé de sang. Deblanc et Fiore partent en Enfer trouver un moyen de stopper le pasteur.

La messe au cours de laquelle Jesse va appeler Dieu dans son église approche et tout Annville se prépare pour l'événement. Avant cela, Tulip veut régler ses comptes avec Carlos.